Sklop »Kontrola AP« je namenjen vnosu kontrole AP. Podatke o kontroli AP uporabnik vpiše s klikom na gumb »Uredi«. Odpre se vnosna maska z naslednjimi polji.
»Številka kontrole AP«
Uporabnik vpiše številko kontrole AP.
»Datum opravljene kontrole«
Uporabnik vnese datum opravljene kontrole oziroma ga izbere iz koledarja, s klikom na .
»Kontrolor
Uporabnik vnese podatek o kontrolorju AP. Podatek se samodejno izpiše, če ima uporabnik dodeljeno uporabniško pravico Kontrolor AP.
»Elektronski naslov«
Izpiše se elektronski naslov kontrolorja. Podatek se izpiše samodejno in je vezan na izbor v polju »Kontrolor«.
»Finančni popravek v znesku«
Uporabnik vpiše znesek finančnega popravka.
»Kontrola prihodkov«
Uporabnik označi ali gre za kontrolo prihodkov (DA/NE).
»Prihodki«
Uporabnik vpiše znesek prihodkov.
»Neupravičeni izdatki
Uporabnik vpiše znesek neupravičenih izdatkov.
»Način izvajanja kontrole«
Uporabnik označi način izvajanja kontrole.
»Opis«
Uporabnik vpiše opis.
»Opomba ob zavrnitvi«:
Uporabnik vpiše opombo ob zavrnitvi.
»Datum zaključka kontrole AP«:
Izpiše se datum zaključka kontrole AP. Izpiše se datum, ko je bil ZZI prestavljen v status »Odobren«, »Kontrolno pregledan« ali »Zavrnjen«.
Po vnosu je treba podatke shraniti s klikom na gumb 
.
Vpisane podatke lahko uporabnik ureja s klikom na gumb 
, in sicer kadar je ZZI v statusu »V kontroli AP« in »Kontrolno pregledan«.
Kontrola AP se lahko izvaja eno- ali dvostopenjsko. Enostopenjska kontrola AP pomeni, da se ZZI, ko se nahaja v kontroli AP in so vsi podatki ustrezni (rešene vse morebitne dopolnitve, ne obstaja nobena zavrnitev) lahko neposredno odobri. Ob tem se v MFERAC pošljejo podatki za pripravo odredb.